A Saint-Yaguen, la gestion des déchets est assurée par le SIETOM de Chalosse, syndicat intercommunal chargé de la collecte et du traitement.
Bien que ce service fonctionne efficacement, les enjeux liés à la réduction des déchets, au tri sélectif et à la sensibilisation des habitants, au tri sélectif et à la sensibilisation des habitants restent au cœur des priorités environnementales.
